Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt1P13864 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt1P13864 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms