Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FosbP13346 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FosbP13346 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FosbP13346 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FosbP13346 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FosbP13346 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FosbP13346 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms