Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms