Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P10404 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
P10404 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
P10404 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
P10404 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
P10404 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P10404 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P10404 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
P10404 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
P10404 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
P10404 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms