Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Tmem254cP0DN91 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254cP0DN91 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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