Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms