Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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