Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf1P09925 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf1P09925 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf1P09925 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf1P09925 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms