Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms