Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtslP06797 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtslP06797 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtslP06797 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtslP06797 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtslP06797 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtslP06797 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms