Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms