Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P04212 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04212 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04212 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04212 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04212 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P04212 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P04212 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P04212 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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