Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tk1P04184 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tk1P04184 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms