Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms