Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa7P02830 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms