Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01808 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01808 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01808 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01808 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01808 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms