Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01679 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01679 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01679 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01679 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01679 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms