Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01673 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01673 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01673 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01673 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01673 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01673 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01673 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01673 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms