Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01667 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01667 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01667 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01667 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01667 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms