Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01649 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01649 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P01649 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P01649 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P01649 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01649 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01649 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms