Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms