Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sypl2O89104 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms