Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms