Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda1O88958 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms