Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms