Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dll3O88516 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms