Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms