Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1O70583 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1O70583 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1O70583 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms