Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx3O70492 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms