Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lnx1O70263 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms