Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad51dO55230 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms