Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms