Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LatO54957 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LatO54957 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LatO54957 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LatO54957 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LatO54957 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LatO54957 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LatO54957 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LatO54957 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LatO54957 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LatO54957 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms