Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms