Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms