Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DffaO54786 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DffaO54786 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DffaO54786 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DffaO54786 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DffaO54786 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DffaO54786 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms