Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EdaO54693 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EdaO54693 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EdaO54693 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EdaO54693 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EdaO54693 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms