Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gp1baO35930 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms