Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r2O35926 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms