Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpibO35906 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpibO35906 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpibO35906 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpibO35906 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpibO35906 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpibO35906 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpibO35906 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpibO35906 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms