Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lhx8O35652 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms