Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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