Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Notch2O35516 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Notch2O35516 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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