Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clk4O35493 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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