Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edil3O35474 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edil3O35474 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms