Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Length 4,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TnxbO35452 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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