Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xbp1O35426 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms