Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms