Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms