Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms